ERCİYES ÜNİVERSİTESİ

 

Metin AK

Pamukkale Üniversitesi

Fen edebiyat Fakültesi

KİMYA BÖLÜMÜ

 

- Ana Sayfa

- CV
- Bildiriler
- Makaleler
- Ders Programı
- Dersler
- Linkler
- Mathcad
- İnteraktif Kimya
     Kimyasal MIME
     Gif Animasyonları
     VRML
     JAVA
     İnteraktif NMR
     İnteraktif IR
     İnteraktif MS
- Leaching Kinetic
- Chemical Software
- Chemical Journal
- İletişim
- Güncel Haberler
- Fotoğraf Albümü
- Ziyaretçi Defteri
 

 

 

 

  RASMOL

 

Rasmol (Raster Molecules):

Dr. Roger Sayle (University Edinburg) tarafından yazılmış olan Rasmol çeşitli formatlardaki dosyalarda bulunan molekülleri görüntüleyebilen en iyi freeware programlardan birisidir. Bu program DNA ve makromoleküller gibi kompleks biyokimyasal sistemleri içeren çeşitli formatlardaki dosya türlerini görüntüleyebilir. Görüntüleyebildiği dosya türleri, Brookhaven Protein Data Bank (PDB), Tripos/ Alchemy, Sybyl Mol2, MDL MOL dosyaları, Minnesota Supercomputer Center’s (MCS), XMol, XYZ ve CHARMm dosya formatlarıdır.

        Rasmol molekülleri wireframe, ball and stick, dreiding cylinder, CPK space-filling, dot surface ve cartoons, ribbons gibi farklı formatlarda görüntüleyebilir.

          Rasmol’ ün en büyük avantajlarından birisi de çeşitli formatlardaki molekülleri GIF gibi tanınmış resim dosyalarına dönüştürebilmesidir.

         Rasmol’ ün menü özelliği sınırlıdır. Manuel olarak değişiklik yaptıktan sonra kaydetme özelliği yoktur. Diğer bir dezavantajı da bir kerede sadece tek molekül görüntülenebilmesidir. Şekilde görülen kontrol panosu ile moleküllerin bağ uzunlukları, bağ açıları hesaplanır. (Raster: Bağımsız renkli noktalar matriksidir.)

          Rasmol’ ün Özellikleri

  1. Maousla molekülü döndürebilir, büyütebilir yada değiştirebiliriz.
  2. Seçilen molekülü ball stick, spacefilling, ribbons v.b. formatlarda görüntüleyebiliriz.
  3. Çeşitli renk düzenlerini uygulayabiliriz. (seconder yapı, sıcaklık v.b.)
  4. Molekülün açıları ve bağ uzunlukları ölçülebilir.
  5. Diğer dosya formatlarına dönüştürülebilir. (GIF, Kinemage, MolScript v.b.)
 
Ar. Gör. METİN AK
Pamukkale Üniversitesi, Fen edebiyat Fakültesi.
<<< KİMYA BÖLÜMÜ >>>
metinak@pamukkale.edu.tr