KineMage(Kinetic İmages):
Kinemage (MAGE olarakta bilinir) biyokimyacıların sık kullandıkları popüler
programlardan biridir. Bu program DNA ve protein yapılarını görüntülemek
amacıyla tasarlanmıştır. Kinemage’ nin molekül görüntüsü, açıklama ve kontrol
panosu için ayrı ayrı birkaç pencerenin açılması bakımından Rasmol’ den
farklıdır. Kontrol paneli yardımıyla moleküllerin sadece belli bölgeleri
görüntülenebilir. Örneğin molekül sadece backbone formatıyla görüntülenebilir ya
da moleküldeki disülfit ve hidrojen bağları veya metal atomları görüntülenip
görüntülenmeyeceği kullanıcının tercihindedir.
Kinemage
Protein Science dergisinin on-line versionu için seçilen bir programdır. Bu
program sadece kinemage formatlı dosyaları okumak amacıyla tasarlanmış olması
programın bir dezavantajıdır. Çünkü çoğu protein ve nükleik asit serileri
Brookhaven Protein Data Bank formatında (PDB) tanımlanmıştır. Fakat bu
dezavantaj ilave bir program kullanılarak (Prekin) giderilebilir.
Prekin PDB formatlı dosyaları Kinemage’ nin görüntüleyebildiği KIN formatına
dönüştürebilir. Kinemage Jane ve David Richardson (Duke University, Durham,
USA) tarafından yazılmıştır.
Kinemage’ nin Özellikleri
-
Maousla
molekülü döndürebilir, büyütebilir ya da değiştirme yapabiliriz.
-
Moleküller stereo formları görüntülenebilir.
-
Bağ
uzunlukları ve açılar ölçülebilir.
-
Farklı
konformasyonların önceden tanımlanmış animasyonları arasında geçiş
yapılabilir.